使用過程中氣相色譜儀可能存在異常情況或故障。基線問題是氣相色譜儀故障之一。我們提到的基線問題包括基線漂移、波動等。這個問題會導致我們的數據出現大的錯誤，這可能導致儀器在嚴苛的條件下發生故障。如果我們發現氣相色譜儀存在基線問題，則必須盡快解決，以避免氣相色譜儀故障并延遲下次使用。我們來看看如何檢查基線問題的維護。

　　當操作氣相色譜儀遇到基線問題時，我們先檢查氣相色譜儀條件是否已更改，是否已更換氣瓶或其他儀器附件。如果不是這種情況，我們需要進一步檢查注射墊是否老化。我們應該經常改變注射墊，養成良好習慣，如果注塑墊沒問題，我們需要檢查是否需要更換石英棉。如果上述情況正常，則需要檢查襯墊是否清潔。如果襯里是干凈的，可能是由于探測器污染造成的。氣相色譜儀基線問題可以通過清潔或熱清潔來解決。

　　氣相色譜儀色譜峰幾何分峰法即從幾何圖形上對重疊峰進行直觀的分割，為常見的有垂線法和切線法。這類方法十分直觀且處理速度很快，可用于實現處理譜圖數據，但是分解的精度隨譜峰重疊的情況而定，沒有保障。垂線法即經過重疊峰的谷點向基線作一垂線，將重疊峰一分為二。可以想象，當兩個氣相色譜儀色譜峰未分離峰大小、形狀都相同，且都是對稱峰時，不管兩峰的重疊程度如何，垂線法分峰都*。在兩未分離峰飛大小相差很大或兩峰不對稱性很高時，隨著氣相色譜儀色譜峰兩峰重疊程度的增加，垂線法的誤差也就隨之增加。